7月20日，国家食品药品监督管理总局（以下简称“CFDA”）公布《关于修改<药品经营质量管理规范>的决定》，并自公布之日起施行。《药品经营质量管理规范》（以下简称“GSP”）根据本决定作相应修改，重新公布。
2016年1月1日起，电子监管药品种类从特殊药品、基础药品扩展至所有药品，监管范围从生产企业扩展至药品零售企业，且按照CFDA要求，凡是未达标到新修改的药品GSP标准的药品经营企业，一律停止药品经营活动。
上述举措引发了药品零售行业反对。2016年1月25日，湖南养天和大药房因不满CFDA强推药品电子监管码，将其诉讼至法院，请求“确认CFDA强制推行电子监管码的行政违法，判令国家食品监管总局立即停止违法行为”。
2016年2月份，CFDA发布公告，暂停执行药品电子监管的有关规定，同时就《药品经营质量管理规范》（修订草案）向社会公开征求意见，主要修订方向就是取消药品电子监管码。
根据国务院办公厅《关于加快推进重要产品追溯体系建设的意见》，对药品流通环节中药品经营企业如何执行药品追溯制度提出了操作性要求,现在修订版GSP显示，其删掉了旧版多个条目，删除了“并满足药品电子监管的实施条件”、“实施电子监管码的药品，还应当按照本规范”等字样，也去除了相关电子监管码的描述。
这意味着电子监管码彻底退出，后续取而代之的是加强药品可追溯体系建设。今年4月28日，CFDA发布《关于进一步完善药品追溯体系的意见（征求意见稿）》指出，建立食品药品追溯体系是企业的主体责任，食品、药品企业如不建立追溯体系，将涉嫌违法犯罪。
在此次修改的新版药品GSP中，加上了“并按照国家有关要求建立药品追溯系统，实现药品可追溯”；将原“执行药品电子监管的规定”改成了“药品追溯的规定”；并直接将“满足药品电子监管的实施条件”改为“满足药品追溯的要求”。
与此同时，新版药品GSP增加了一条，即对麻醉药品、精神药品、药品类易制毒化学品的要求是“追溯应当符合国家有关规定”。
在本次药品GSP修改中，大量出现“追溯”二字，但并无追溯体系具体做进一步解释与要求。不过，《关于进一步完善食品药品追溯体系的意见》（以下简称“《意见》”）将是修订版药品GSP配套政策，该《意见》鼓励生产经营企业运用信息技术建立食品药品追溯体系；鼓励信息技术企业作为第三方，提供产品追溯专业服务。但是也明确要求各级食药监管部门不得强制要求食品、药品生产经营企业接受指定的专业信息技术企业的追溯服务。
而此前备受争议的阿里健康，亦大力投向追溯平台的建设。阿里健康追溯新平台将完善兼容“中国药品电子监管码”的技术标准，同时为原中国药品电子监管网上的医疗机构和药品企业免费提供入驻新平台的服务。阿里健康相关负责人向21世纪经济报道记者表示，未来三年内，阿里健康免去向入驻企业收取发码、流向查询等基础追溯服务的费用，仅会收取数据储存、借口调用等技术支撑费用。
